Při mnoha druzích ekzému je příčina vzniku neznámá. Velké množství ekzémů však zapříčiňuje kombinace genů a určitých vnútrotelových spouštěčů.
Říká se, že lidé, kteří trpí ekzémem, mají nadměrně reaktivní imunitní systém. Z toho vyplývá, že ekzém je reakce imunitního systému na látku v těle, nebo mimo něj (např. Alergeny ve vzduchu). Ekzém tedy můžeme považovat za autoimunitní onemocnění, které, když se v těle člověka spustí, projevuje zčervenal, zánětem a svědivými bolestivými vyrážkami po celém těle. Některé výzkumné studie prokázaly, že pojivem s touto komplexní poruchou může být specifický gen nazýván Filaggrin. Filaggrin hraje klíčovou roli ve funkci epidermální bariéry a asociace s atopickou dermatitidou ukazuje jeho důležitost. Lidem trpícím na ekzémy pravděpodobně chybí část zmíněného genu a to je činí velmi zranitelnými vůči vnějším a vnitřním spouštěčem.
I když není známa přesná příčina ekzému, určitě existuje mnoho spouštěčů, které mohou mít vliv na závažnost ekzému. Některé z nich jsou: